56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5007 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  100 
 
 		 363 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  82.37 
 
 		 362 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  80.99 
 
 		 362 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  62.46 
 
 		 362 aa  454  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  61.9 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  54.97 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  53.96 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.12 
 
 		 765 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  52.01 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  53.39 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  50.86 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  50.57 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  50.57 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  49.22 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.63 
 
 		 475 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  32.34 
 
 		 330 aa  136  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  30.74 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  34.29 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  28.92 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.62 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  24.53 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.11 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  24.01 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  24.01 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  24.01 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  24.01 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  23.93 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.95 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  25.91 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.81 
 
 		 309 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  25.74 
 
 		 372 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  20.94 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.9 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  21.76 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  24.29 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  23.02 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 361 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  23.27 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  21.5 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  31.34 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.25 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  31.34 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  24.35 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 332 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  24.55 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>