16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22677 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  100 
 
 
321 aa  669    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  39.32 
 
 
429 aa  232  6e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  39.48 
 
 
327 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  37.92 
 
 
371 aa  218  7.999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.282739 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  35.8 
 
 
418 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  34.38 
 
 
387 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  36.91 
 
 
343 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  35.16 
 
 
345 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46383  predicted protein  32.52 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372126  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.23 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  25.95 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  23.66 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
378 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>