17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3079 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  100 
 
 
332 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1804  Fatty acid desaturase  50.76 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  44.35 
 
 
346 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4769  fatty acid desaturase  43.79 
 
 
305 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.237988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5211  fatty acid desaturase  34.23 
 
 
321 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121339  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5106  fatty acid desaturase  34.45 
 
 
318 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  25.45 
 
 
387 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  23.98 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  26.35 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  61.29 
 
 
429 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  24.17 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  25.46 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  26.09 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  27.3 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>