69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3139 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  55.14 
 
 
318 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  47.04 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  37.84 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  37.84 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  37.54 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  37.16 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  37.97 
 
 
390 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  37.84 
 
 
341 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  37.16 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  37.37 
 
 
431 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.86 
 
 
359 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.86 
 
 
359 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.86 
 
 
346 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.86 
 
 
346 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.86 
 
 
424 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  36.82 
 
 
341 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  36.86 
 
 
359 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.52 
 
 
359 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  34.39 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  36.9 
 
 
328 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  36.3 
 
 
367 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  34.14 
 
 
313 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  34.14 
 
 
330 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  34.81 
 
 
368 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  34.31 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  37.59 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.09 
 
 
765 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  26.82 
 
 
349 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
362 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  26.15 
 
 
378 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  30.51 
 
 
489 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  27.98 
 
 
344 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  25.29 
 
 
370 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
340 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
360 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
360 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  26.34 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  27.84 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25.97 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
343 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  25.66 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  24.07 
 
 
360 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  22.69 
 
 
346 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  39.62 
 
 
685 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  27.56 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  23.08 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  23.05 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25.4 
 
 
475 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  25.21 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  23.05 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  24.89 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  25.73 
 
 
362 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  25.74 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  24.47 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  24.09 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  25.3 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  25.3 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  25.3 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  25.3 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  25.3 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>