71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1456 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  100 
 
 
362 aa  740    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  63.07 
 
 
362 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  62.89 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  62.46 
 
 
363 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  54.76 
 
 
363 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.52 
 
 
765 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  50.29 
 
 
378 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  50.57 
 
 
360 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  51.17 
 
 
340 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  49 
 
 
360 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  49 
 
 
360 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  49 
 
 
360 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  49.55 
 
 
358 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  46.69 
 
 
344 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.08 
 
 
475 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  31.27 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  30.34 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  32.57 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  28.52 
 
 
311 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.9 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.86 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.4 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  24.63 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  24.71 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  23.24 
 
 
540 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.7 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  23.64 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  23.92 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  24.24 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  24.24 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  24.24 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  24.24 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  27.93 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  21.45 
 
 
368 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  23.95 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.67 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  26.87 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.13 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  24.83 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  22.97 
 
 
293 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  25.45 
 
 
339 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  21.86 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  23.01 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
332 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  23.65 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  22.86 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  23.56 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  23.43 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  24.16 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  23.2 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.89 
 
 
361 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  27.23 
 
 
311 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.7 
 
 
391 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  25.73 
 
 
290 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  24.72 
 
 
344 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.25 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  28.57 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  29.85 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  47.22 
 
 
517 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  23.46 
 
 
307 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>