61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0650 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  100 
 
 		 339 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  51.47 
 
 		 320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  53.31 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  50.81 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  43.89 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  41.1 
 
 		 343 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  39.38 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  37.89 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  37.89 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  37.89 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  37.89 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  37.89 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  38.2 
 
 		 540 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  37.89 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  39.75 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  32.7 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  32.44 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  30.71 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  33.62 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  28.96 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.17 
 
 		 486 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  30.43 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  29.04 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  26.43 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  29.33 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  28.94 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  25.83 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  27.24 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  28.24 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.6 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  25 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.57 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  25.63 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  25.63 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  25.63 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  32.1 
 
 		 113 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  21.83 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  24.48 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  22.67 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  27.07 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.91 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  23.19 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  26.18 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  24.87 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  23.6 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>