66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0465 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  100 
 
 		 343 aa  695    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  48.97 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  50.29 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  47.76 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  44.94 
 
 		 307 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  41.1 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  39.88 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  41.23 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  41.23 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  41.23 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  41.23 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  41.42 
 
 		 540 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  40.94 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  37.46 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  32.23 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  31.4 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  31.13 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  33.03 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  29.85 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  30.09 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  20.96 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  26.33 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  27.68 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  28.22 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  26.4 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.55 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  24.68 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.26 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  27.11 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  25.95 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.03 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  23.05 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  26.74 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  28.21 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  21.81 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  24.1 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  35.79 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  35.79 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  24.31 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  24.65 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  24.65 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  24.76 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.88 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  28.87 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  24.31 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.17 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  22.53 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  23.81 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  32.26 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  29.51 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  23.2 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  38.46 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  23.1 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  20.98 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  27.67 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  31.62 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>