55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2063 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  100 
 
 		 303 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  30.77 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  32.72 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  39.47 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  39.47 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  39.47 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  30.71 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  28.75 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  27.06 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  27.19 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  28.07 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  28.57 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  28.57 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  28.07 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  28.57 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  32.2 
 
 		 350 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  28.07 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  28.57 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25.27 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  27.91 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  26.82 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  27.84 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  27.23 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  25 
 
 		 489 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.94 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  27.82 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  29.04 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  26.54 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  27.18 
 
 		 486 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.19 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  28.04 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  28.02 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  21.48 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  24.3 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  24.46 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  26.92 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  26.74 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  24.3 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  28 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  24.3 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  28 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  32.63 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  32.63 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  24.48 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  25.39 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>