67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6151 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  100 
 
 		 315 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  91.43 
 
 		 315 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  89.52 
 
 		 315 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  89.52 
 
 		 342 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  89.52 
 
 		 315 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  30.51 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.38 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  29.54 
 
 		 540 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  28.83 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  28.83 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  28.83 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  28.83 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  28.83 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.11 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  26.75 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  24.58 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  30.77 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  26.75 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.29 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  23.66 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  25.88 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  24.04 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.31 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  22.18 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  26.25 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  22.38 
 
 		 344 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  30.37 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  23.22 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  23.7 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  23.3 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.82 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  24.32 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  21.9 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  23.38 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  23.38 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  30.12 
 
 		 431 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  23.6 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  34.21 
 
 		 427 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  23.89 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  26.7 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  28.26 
 
 		 486 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  24.51 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  22.14 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  23.7 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  27.06 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  26.01 
 
 		 489 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  30.95 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  32.94 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  25 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  33.75 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  21.83 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 463 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  30.97 
 
 		 363 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  24.47 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>