83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2182 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  100 
 
 		 318 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  55.14 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  43.64 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  40.07 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  35.78 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  35.56 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  36.76 
 
 		 431 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  35.87 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  34.92 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  34.92 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  35.81 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  35.67 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  34.92 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  37.97 
 
 		 390 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.49 
 
 		 424 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.49 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.49 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.49 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.49 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  36.49 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  36.49 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  32 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  33.78 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  32.9 
 
 		 368 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  32.9 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  32.73 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  37.88 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  30.24 
 
 		 489 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25.58 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.47 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  26.01 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  26.8 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  24.9 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  21.48 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  22.99 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  24.5 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  24.5 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.48 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  25.54 
 
 		 486 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  22.06 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  25.28 
 
 		 378 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  26.79 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 360 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.13 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.13 
 
 		 540 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.13 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.13 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.13 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  23.36 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.28 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  22.02 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  24.27 
 
 		 685 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  26.07 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  24.16 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  24.88 
 
 		 463 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.13 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  22.87 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  23.31 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  22.74 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  23.74 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  26.36 
 
 		 427 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  25 
 
 		 362 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  25.28 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>