70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0992 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  100 
 
 		 317 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  55.52 
 
 		 348 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  37.02 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  36.24 
 
 		 374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  35.45 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  34.88 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  35.91 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  34.55 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  34.07 
 
 		 351 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  32.19 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  35.48 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  35.36 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  31.87 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  32.58 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  32.26 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  32.9 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  32.26 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  31.12 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  32.89 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  32.51 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  32.89 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  32.26 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  32.55 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  34.43 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  35.16 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  33.22 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  35.16 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  26.58 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  27.39 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  25.43 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  25.64 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  27.3 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  26.01 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  25.41 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  26.4 
 
 		 361 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  26.36 
 
 		 333 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  25 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.53 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  22.41 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  21.07 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.37 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  30.83 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  20.75 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  20.75 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  24.61 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.17 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.26 
 
 		 359 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  22.51 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  21.6 
 
 		 424 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  25.86 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  21.25 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  21.25 
 
 		 426 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.25 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  21.25 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.28 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.38 
 
 		 410 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  36.84 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  24.1 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  23.21 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1804  Fatty acid desaturase  21.48 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.59 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  23.85 
 
 		 495 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  26.35 
 
 		 380 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>