40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24321 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  100 
 
 		 346 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  75.95 
 
 		 341 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  72.24 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  75.94 
 
 		 349 aa  521  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  72.01 
 
 		 343 aa  517  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  72.3 
 
 		 343 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  69.59 
 
 		 299 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  73.16 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  71.86 
 
 		 266 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  59.74 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  71.43 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  60.9 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  60.9 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  58.05 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  58.33 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  55.25 
 
 		 306 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  56.57 
 
 		 325 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  54.98 
 
 		 293 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  28 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  28.57 
 
 		 685 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  29.77 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  26.25 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  27.6 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.56 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  25.65 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  26.99 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  22.99 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  34.52 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  21.68 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  19.88 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  22.69 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  31.73 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  28.89 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  27.46 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  24.6 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  23.28 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  23.39 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  31.62 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>