13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5230 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  52.7 
 
 
258 aa  274  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  50.4 
 
 
254 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0972  beta-carotene ketolase  39.26 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0162897  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  26.99 
 
 
346 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  26.36 
 
 
349 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5106  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  25.3 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  25.3 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  32.52 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  34.11 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  26.63 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  26.24 
 
 
341 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>