42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03151 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  99.42 
 
 		 343 aa  709    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  100 
 
 		 343 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  73.67 
 
 		 341 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  72.3 
 
 		 346 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  67.26 
 
 		 370 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  71.2 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  74.66 
 
 		 299 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  74.73 
 
 		 277 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  75.19 
 
 		 266 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  74.27 
 
 		 241 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  58.45 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  58.25 
 
 		 298 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  57.69 
 
 		 306 aa  352  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  58.72 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  58.72 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  59.79 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  56.84 
 
 		 325 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  57.71 
 
 		 293 aa  336  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  28.79 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  29.17 
 
 		 685 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  32.54 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.44 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  23.01 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  31.3 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  33.98 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  22.71 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  33.02 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  29.25 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  31.63 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  25.64 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  25.69 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  22.43 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  22.58 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  21.62 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  20 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  34.34 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  22.46 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  22.14 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  21.7 
 
 		 313 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>