27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0238 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  95.47 
 
 		 277 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  87.22 
 
 		 299 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  95.42 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  79.7 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  71.86 
 
 		 346 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  70.3 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  68.8 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  75.19 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  75.19 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  64.05 
 
 		 331 aa  348  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  64.17 
 
 		 306 aa  331  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  61.6 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  61.47 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  63.2 
 
 		 291 aa  316  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  61.47 
 
 		 291 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  63.64 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  59.07 
 
 		 325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  28.92 
 
 		 685 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  32.27 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 371 aa  85.5  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.09 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  23.74 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  21.61 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.56 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  35.94 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  40.74 
 
 		 469 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>