41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0286 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  100 
 
 		 349 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  87.61 
 
 		 370 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  75.94 
 
 		 346 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  70.25 
 
 		 341 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  71.2 
 
 		 343 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  71.2 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  70.65 
 
 		 299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  70.76 
 
 		 277 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  70.3 
 
 		 266 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  62.15 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  70.54 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  59.23 
 
 		 306 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  58.87 
 
 		 291 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  58.87 
 
 		 291 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  56.25 
 
 		 298 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  58.45 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  59.03 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  56.43 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  29.93 
 
 		 685 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  29.62 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  31 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  26.82 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  25.33 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  24.43 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  21.48 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  28 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  35.14 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  24.06 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  27.39 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  26.36 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  25.09 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  35.58 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.31 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  21.92 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.46 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  23.62 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  31 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  23.25 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 258 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>