44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2058 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  100 
 
 		 370 aa  760    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  87.61 
 
 		 349 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  72.24 
 
 		 346 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  67.89 
 
 		 341 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  71.84 
 
 		 343 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  67.26 
 
 		 343 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  70.31 
 
 		 299 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  69.68 
 
 		 277 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  68.8 
 
 		 266 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  60.67 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  69.29 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  57.84 
 
 		 306 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  59.22 
 
 		 291 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  59.22 
 
 		 291 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  56.6 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  57.75 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  55.96 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  55.71 
 
 		 293 aa  329  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  29.73 
 
 		 685 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  28.24 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  30.14 
 
 		 309 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.59 
 
 		 330 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.22 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  36.36 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  24.74 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  25.29 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  26.75 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  34.62 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.51 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  22.06 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  23.79 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  24 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  30.43 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  30.16 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.24 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.49 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  29.37 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.45 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  24.31 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  24.89 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  22.51 
 
 		 535 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  27.67 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.45 
 
 		 352 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>