38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02591 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  100 
 
 
341 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  75.95 
 
 
346 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  73.08 
 
 
343 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  73.67 
 
 
343 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  67.89 
 
 
370 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  70.25 
 
 
349 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  75.68 
 
 
299 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  78.1 
 
 
277 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  79.7 
 
 
266 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  78.15 
 
 
241 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  58.22 
 
 
331 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  58.1 
 
 
291 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  56.7 
 
 
298 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  58.1 
 
 
291 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  57.34 
 
 
306 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  56.54 
 
 
291 aa  338  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  57.35 
 
 
293 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  53.07 
 
 
325 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  26.86 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  30.04 
 
 
685 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  32.71 
 
 
309 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.25 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  31.37 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  22.27 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  22.36 
 
 
360 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  32.18 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  28.64 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  31.91 
 
 
455 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  22.88 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  22.02 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  26.53 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  29.51 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  22.43 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  22.38 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  22.83 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>