49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3476 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  100 
 
 		 368 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  67.27 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  65.55 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  46.39 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  48.78 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  46.33 
 
 		 341 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  47.28 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  47.92 
 
 		 341 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  47.92 
 
 		 341 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  46.96 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  49.16 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  45.75 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  45.48 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  45.48 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  45.48 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  45.48 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  45.48 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  45.48 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  45.48 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  47.59 
 
 		 390 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  44.48 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  47.12 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  38.62 
 
 		 296 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  37.59 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  32.9 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  34.81 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  30.49 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25.48 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  24.46 
 
 		 291 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5835  fatty acid desaturase domain-containing protein  52.17 
 
 		 60 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.805516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  24.48 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  23.08 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  23.78 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  23.78 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  23.78 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  23.78 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  23.78 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  23.78 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.01 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  22.47 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  23.42 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.47 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  28.76 
 
 		 489 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  25.2 
 
 		 685 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  22.47 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  22.7 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.29 
 
 		 486 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  22.3 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>