42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1009 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  100 
 
 		 367 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  78.66 
 
 		 330 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  65.55 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  50.32 
 
 		 355 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  47.8 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  48.11 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  48.11 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  47.48 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  47.48 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  46.86 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.24 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.24 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.24 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  48.24 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.24 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.24 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  47.92 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  47.49 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  47.66 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  46.96 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  44.16 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  46.35 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  40.07 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  36.39 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  34.94 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  36.16 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  29.27 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  24.05 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  25.6 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.76 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  23.87 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.86 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  44.44 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  23.4 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5835  fatty acid desaturase domain-containing protein  57.5 
 
 		 60 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.805516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  22.84 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  22.65 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  25.6 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  23.42 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>