35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1444 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  100 
 
 
355 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  54.63 
 
 
328 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  50.65 
 
 
330 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  46.39 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  48.7 
 
 
341 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  48.05 
 
 
341 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  48.05 
 
 
431 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  50.32 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  48.05 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  48.38 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  48.38 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  47.52 
 
 
424 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.85 
 
 
359 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.85 
 
 
346 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.85 
 
 
346 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  48.85 
 
 
359 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.85 
 
 
359 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  48.85 
 
 
359 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  47.25 
 
 
390 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  46.13 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  47.74 
 
 
312 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  40.27 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  35.81 
 
 
318 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  34.39 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  34.26 
 
 
304 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  34.73 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5835  fatty acid desaturase domain-containing protein  59.52 
 
 
60 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.805516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
489 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.33 
 
 
311 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  26.09 
 
 
321 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  21.99 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  25.3 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  28 
 
 
315 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>