45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2394 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  100 
 
 
304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  47.04 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  43.64 
 
 
318 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  43.39 
 
 
296 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  37.59 
 
 
368 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  35.93 
 
 
330 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.49 
 
 
390 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.83 
 
 
424 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.97 
 
 
359 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.97 
 
 
346 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.97 
 
 
346 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.97 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.97 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  38.97 
 
 
359 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  39.48 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  37.59 
 
 
341 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  37.93 
 
 
431 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  37.59 
 
 
341 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  37.59 
 
 
341 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  36.16 
 
 
367 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  38.52 
 
 
341 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  34.26 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  36.33 
 
 
341 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  34.15 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  34.92 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  37.13 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  39.24 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  33.89 
 
 
486 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  31.3 
 
 
489 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  29.51 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.16 
 
 
339 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  28 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  25.37 
 
 
298 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.59 
 
 
324 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  30.6 
 
 
317 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  26.09 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  25.19 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.82 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  24.81 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>