76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0117 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  99.7 
 
 
333 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  99.7 
 
 
333 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  99.4 
 
 
333 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 
333 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  99.1 
 
 
343 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  99.7 
 
 
333 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  99.35 
 
 
309 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  33.86 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  33.86 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  33.86 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  33.86 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  33.86 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  33.86 
 
 
540 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  33.2 
 
 
339 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  32.27 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  33.62 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  30.77 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  33.61 
 
 
320 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  33.47 
 
 
339 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  31.35 
 
 
311 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  30.74 
 
 
307 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  31.03 
 
 
343 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  25.32 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  28.52 
 
 
313 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.43 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  28.85 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  26.89 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.76 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  30.6 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  31.45 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  27.8 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25.51 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  25.58 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  24.4 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.25 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  28.79 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  29.44 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  27.56 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4765  fatty acid desaturase  29.03 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  30 
 
 
387 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  24.71 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  27.1 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  27.71 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  24.31 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  25.35 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.82 
 
 
765 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
377 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  25.46 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  25.63 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  24.3 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  25.66 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  24.77 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
376 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  24.77 
 
 
291 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3059  fatty acid desaturase  28.85 
 
 
371 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  23.9 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  40.74 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  25.36 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  23.59 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  28.62 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  28.07 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.64 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.64 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  26.32 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.64 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  26.7 
 
 
336 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.64 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.92 
 
 
359 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
362 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  26.07 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.64 
 
 
424 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>