16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3059 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3059  fatty acid desaturase  100 
 
 
371 aa  758    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2178  fatty acid desaturase  38.95 
 
 
368 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0268  Fatty acid desaturase  36.28 
 
 
390 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2878  fatty acid desaturase  37.61 
 
 
364 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.99559  normal  0.040832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0493  fatty acid desaturase  35.24 
 
 
371 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  22.9 
 
 
336 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  22.51 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  28.85 
 
 
309 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  37.35 
 
 
477 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>