8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0493 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0493  fatty acid desaturase  100 
 
 
371 aa  731    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2178  fatty acid desaturase  59.31 
 
 
368 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2878  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
364 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.99559  normal  0.040832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0268  Fatty acid desaturase  41.77 
 
 
390 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3059  fatty acid desaturase  35.54 
 
 
371 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.49 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3898  fatty acid desaturase  21.92 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130799  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.36 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>