20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3898 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3898  fatty acid desaturase  100 
 
 		 349 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.3 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.76 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2878  fatty acid desaturase  22.36 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.99559  normal  0.040832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  21.52 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  22.08 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  22.69 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  23.72 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  21.03 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  38.6 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  25.11 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  21.19 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2178  fatty acid desaturase  22.15 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  35.09 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  29.58 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  35.09 
 
 		 440 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  22.3 
 
 		 311 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>