92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0916 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  100 
 
 
339 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  63.08 
 
 
329 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  62.77 
 
 
328 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  62.77 
 
 
328 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  62.77 
 
 
328 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  62.77 
 
 
540 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  62.46 
 
 
328 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  62.77 
 
 
328 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  39.69 
 
 
321 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  41.18 
 
 
330 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  40.37 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  37.57 
 
 
343 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  37.85 
 
 
320 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  38.53 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  35.53 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
343 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
333 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
309 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
333 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
333 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
333 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  33.33 
 
 
333 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  34.66 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  33.94 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  28.87 
 
 
338 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  26.65 
 
 
336 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  32.2 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  29.69 
 
 
486 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  26.65 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  30.33 
 
 
489 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  30.58 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.18 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  27.39 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.59 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  28.37 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.03 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  27.44 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  27.9 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
362 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  28.35 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  28.08 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  28.18 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  26.1 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  26.55 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  28.26 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  28.67 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.69 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  26.78 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.53 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  28.01 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  28.34 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  24.71 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  25 
 
 
383 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.74 
 
 
765 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  28.62 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.97 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0493  fatty acid desaturase  27.49 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824191  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  27.6 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
463 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4765  fatty acid desaturase  25.71 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  27.85 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  22.39 
 
 
313 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  29.11 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  29.1 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  26.91 
 
 
315 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.08 
 
 
424 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.37 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.37 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.37 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  27.04 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  23.48 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.24 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  26.38 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.24 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  26.98 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  25.07 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  22.55 
 
 
427 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  28.03 
 
 
341 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  23.99 
 
 
355 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  26.98 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  26.98 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
431 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  24.04 
 
 
327 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.74 
 
 
357 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>