77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2765 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  100 
 
 		 324 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  58.04 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  59.93 
 
 		 300 aa  359  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  35.22 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  35.79 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  32 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  31.2 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  30 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  30 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  30 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  30 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  27.57 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  27.16 
 
 		 427 aa  99.8  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.57 
 
 		 475 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 		 765 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 358 aa  92.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  26.9 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  27.6 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.47 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  25.73 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.04 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  25.73 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  25.73 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  25.73 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  25.73 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  28.24 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  24.84 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.43 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.43 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.43 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.43 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.43 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.43 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  26.99 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  23.59 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  25.83 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  25.6 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  26 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.42 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  23.66 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  25.81 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  25.99 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  25.99 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  24.75 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.72 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  24.35 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  22.98 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  22.52 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  23.35 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  22.97 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>