48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4996 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  98.24 
 
 		 341 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  100 
 
 		 341 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  100 
 
 		 341 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  90.62 
 
 		 341 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  87.1 
 
 		 341 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  86.8 
 
 		 341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  82.4 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  74.2 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  77.88 
 
 		 390 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 346 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 346 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  73.91 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  74.49 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  50.16 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  47.92 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  47.76 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  48.38 
 
 		 355 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  47.44 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  48.11 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  49.04 
 
 		 312 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  41.58 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  37.84 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  34.92 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  37.59 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  36.4 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.31 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.98 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.98 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.98 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.98 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.98 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.96 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.64 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.1 
 
 		 540 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.22 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  27.21 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.94 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  26.41 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.69 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  27.12 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.99 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  29.26 
 
 		 307 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  28.4 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>