82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0284 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  100 
 
 
336 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  58.04 
 
 
324 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  63.49 
 
 
300 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  35.15 
 
 
330 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  35.81 
 
 
311 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  29.08 
 
 
344 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  32.12 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  29.69 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  29.54 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  28.67 
 
 
340 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  29.45 
 
 
363 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  29.2 
 
 
360 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  29.2 
 
 
360 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  31.35 
 
 
362 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  29.2 
 
 
360 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  30.74 
 
 
363 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.26 
 
 
475 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  30.34 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  29.7 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  26.8 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.11 
 
 
765 aa  89.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  28.23 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  29.23 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  27.09 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  27.04 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.58 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  27.1 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  25 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  29.96 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  25.58 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  28.11 
 
 
328 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  27.71 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  27.71 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  27.71 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  26.09 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  27.71 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.19 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
540 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  29.21 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  27.12 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.22 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  25.66 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
314 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  38.1 
 
 
376 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  28.97 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  34.94 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  30.97 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  24.16 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0156  fatty acid desaturase  22.51 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  22.9 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  22.7 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.7 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.08 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  23.4 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  26.7 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
341 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.38 
 
 
349 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.39 
 
 
352 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  22.43 
 
 
431 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>