40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0209 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.13 
 
 
346 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.13 
 
 
346 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 
359 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.16 
 
 
359 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.16 
 
 
359 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.16 
 
 
359 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  98.89 
 
 
424 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  86.27 
 
 
390 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  73.91 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  73.33 
 
 
341 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  73.91 
 
 
341 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  73.91 
 
 
341 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  73.04 
 
 
431 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  75 
 
 
341 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  73.04 
 
 
341 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  45.48 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  49.52 
 
 
313 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  46.39 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  48.71 
 
 
355 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  48.24 
 
 
367 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  43.28 
 
 
328 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  50.47 
 
 
312 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  43.84 
 
 
296 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  36.86 
 
 
290 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  36.49 
 
 
318 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  38.97 
 
 
304 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  37.35 
 
 
343 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.06 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.21 
 
 
330 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  28.27 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  28.27 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  28.27 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  28.27 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.46 
 
 
328 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.89 
 
 
311 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.66 
 
 
540 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.75 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.01 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.26 
 
 
489 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>