17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3477 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  100 
 
 		 377 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.27 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  22.39 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  18.45 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  21.7 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  30.86 
 
 		 338 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  24.21 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  24 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  24 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  24 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  24 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  24.3 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  24 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  24 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3390  hypothetical protein  24.31 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  23.31 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40020  hypothetical protein  23.76 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>