10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3390 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_40020  hypothetical protein  83.73 
 
 		 424 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  876    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6169  fatty acid desaturase  30.71 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88883  decreased coverage  0.00544471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3443  fatty acid desaturase  27.72 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4357  fatty acid desaturase  30.65 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2445  hypothetical protein  29.28 
 
 		 308 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  22.41 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2950  hypothetical protein  23.51 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  24.31 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>