19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02366 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  100 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.53 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  35.11 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  26.25 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  26.09 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  35.11 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  27.45 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  35.9 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  34.34 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  23.68 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  32.97 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.74 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  25.53 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  26.77 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  23.77 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  32.93 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  30.43 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>