10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5211 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5211  fatty acid desaturase  100 
 
 
321 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121339  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5106  fatty acid desaturase  37.19 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1804  Fatty acid desaturase  33 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  34.23 
 
 
332 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  32.62 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4769  fatty acid desaturase  29.62 
 
 
305 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.237988  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  27.49 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  27.3 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.28 
 
 
354 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>