52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3498 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  98.92 
 
 
370 aa  753    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  100 
 
 
370 aa  761    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  50.14 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  45.33 
 
 
368 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  46.59 
 
 
368 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  46.03 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  44.66 
 
 
368 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  33.14 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  32.86 
 
 
343 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  32.86 
 
 
343 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  33.14 
 
 
343 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  32.86 
 
 
343 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  32.86 
 
 
343 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  32.86 
 
 
343 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  32.94 
 
 
319 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  32.94 
 
 
319 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  32.94 
 
 
319 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  30.29 
 
 
351 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  28.73 
 
 
354 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  32.52 
 
 
356 aa  156  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  30 
 
 
328 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  27.71 
 
 
349 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  29.43 
 
 
349 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  30.12 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  28.94 
 
 
348 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  29.83 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  29.09 
 
 
357 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  28.41 
 
 
352 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  27.41 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  28.33 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  27.52 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  27 
 
 
376 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  26.9 
 
 
348 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.43 
 
 
317 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  32.56 
 
 
358 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.07 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  27.6 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.71 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.26 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  22.12 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  25.34 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.3 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.81 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  21.79 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  21.8 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  22.43 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  24.72 
 
 
180 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  23.89 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  31.43 
 
 
471 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.33 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  32.26 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>