50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14121 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
361 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
370 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
370 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  50.14 
 
 
368 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  46.89 
 
 
368 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  48.58 
 
 
368 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  48.43 
 
 
368 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  43.06 
 
 
333 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  29.68 
 
 
349 aa  146  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  30.31 
 
 
349 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  30.4 
 
 
374 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  30.46 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  29.63 
 
 
349 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  30.42 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  29.9 
 
 
376 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  26.42 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  26.42 
 
 
343 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  26.57 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  26.14 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  26.29 
 
 
319 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  26.29 
 
 
319 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  30.37 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  29.34 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  28.25 
 
 
353 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  29.06 
 
 
356 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  27.39 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  28.24 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  28.81 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  30.87 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  26.42 
 
 
348 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.82 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  26.18 
 
 
335 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  34.74 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  33.33 
 
 
498 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  24.43 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  32.97 
 
 
359 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.12 
 
 
359 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  31.76 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.94 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  31.58 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  40 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  21.26 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  33.33 
 
 
495 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  38 
 
 
357 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>