61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1473 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  88.32 
 
 		 368 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 		 368 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  87.5 
 
 		 368 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  74.46 
 
 		 368 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  46.91 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  46.3 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  46.03 
 
 		 370 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  44.14 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  26.97 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  26.97 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.97 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  26.97 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  26.4 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  27.41 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  26.4 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  27.41 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  27.41 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  27.09 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  27.14 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.65 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.71 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  26.01 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  29.01 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  25.28 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  23.99 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  25.51 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  25.43 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  25.79 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  27.38 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.77 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  24.2 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  20.22 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.31 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.42 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.1 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  23.51 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  23.65 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  19.22 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.92 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.88 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  30.77 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  23.33 
 
 		 495 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  28.26 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.06 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.71 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  21.72 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  32.88 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  24.65 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  35.21 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  22.44 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.67 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  45.95 
 
 		 545 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  22.61 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  30.77 
 
 		 388 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>