57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15871 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
368 aa  740    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  90.76 
 
 
368 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  87.5 
 
 
368 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  75.27 
 
 
368 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  46.33 
 
 
361 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  44.66 
 
 
370 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  44.66 
 
 
370 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  44.44 
 
 
333 aa  292  7e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.61 
 
 
343 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
343 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  26.05 
 
 
343 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
343 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  27.91 
 
 
319 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  27.91 
 
 
319 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  27.91 
 
 
319 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.27 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  25.21 
 
 
351 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.85 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  27.12 
 
 
357 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  26.59 
 
 
349 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.42 
 
 
349 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  27.87 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.72 
 
 
349 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  24.78 
 
 
352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  24.21 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
348 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  27.12 
 
 
358 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.8 
 
 
317 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  26.69 
 
 
328 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  23.96 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  34.15 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  22.01 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.37 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.99 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  21.32 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  23.21 
 
 
498 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  24.05 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  23.41 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.57 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.13 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  21.99 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  22.55 
 
 
495 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  36.67 
 
 
471 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  29.52 
 
 
393 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  21.77 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  23.68 
 
 
448 aa  46.2  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.24 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  26.98 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.56 
 
 
352 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  45.95 
 
 
545 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  33.8 
 
 
180 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>