35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3907 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
276 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  48.35 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  34.18 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  28.4 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  30.12 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  30.43 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  31.71 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  30.43 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  30.43 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  30.43 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  28.4 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  30 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  29.81 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  28.98 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  30.18 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  30.14 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  27.1 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  27.87 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  28.38 
 
 
376 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  30.87 
 
 
183 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  23.22 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  29.21 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  25.37 
 
 
490 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  25.15 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  28.71 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  28.71 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  26.5 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  23.3 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  25.5 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  23.68 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  25.53 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  28.33 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  25.76 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>