39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0011 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  54.19 
 
 
215 aa  232  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  43.43 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  32.99 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  32.46 
 
 
204 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 
210 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  34.6 
 
 
222 aa  121  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  33.49 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  33.16 
 
 
235 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  34.8 
 
 
369 aa  101  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  31.75 
 
 
376 aa  92  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  29.03 
 
 
490 aa  91.3  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  37.32 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  37.32 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  37.32 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  37.32 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  37.32 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  37.32 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  38.19 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  38.19 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  36.67 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  30.66 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  29.1 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  29.93 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  27.34 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  24.85 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  25.9 
 
 
252 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  23.32 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  23.22 
 
 
276 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  25.97 
 
 
221 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  25.35 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  28.19 
 
 
381 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  23.31 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  23.57 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  24.65 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  24.65 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  25 
 
 
260 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>