30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0010 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  57.62 
 
 
224 aa  257  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  57.62 
 
 
224 aa  257  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  57.14 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  54.88 
 
 
221 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  55.09 
 
 
244 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  35.56 
 
 
252 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  36.95 
 
 
250 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  36.89 
 
 
287 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4993  fatty acid hydroxylase  38.21 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  30.81 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  32.34 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  31.41 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  31.41 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  27.86 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  29.31 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  29.89 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  33.11 
 
 
209 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  27.36 
 
 
209 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  28.1 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  28.7 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  31.07 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 
240 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33435  predicted protein  25.96 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  29.67 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  29.12 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  23.57 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  26.8 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
182 aa  42.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>