35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3873 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  35.2 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  35.44 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  27.72 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  29.26 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  34.36 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  33.69 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  30.46 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  30.32 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  31.79 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  26.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  31.79 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  30.46 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  30.46 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  31.79 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  31.85 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  29.8 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  29.8 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  29.14 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  29.1 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.220259 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  31.02 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  33.75 
 
 		 367 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  33.75 
 
 		 371 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  33.75 
 
 		 371 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  33.75 
 
 		 367 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  33.75 
 
 		 371 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  33.75 
 
 		 367 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  33.75 
 
 		 367 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  31.58 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  30.25 
 
 		 369 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>