33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3036 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  61.43 
 
 
235 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  46.64 
 
 
225 aa  203  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  42.57 
 
 
206 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  39.13 
 
 
210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  42.21 
 
 
204 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  34.6 
 
 
209 aa  121  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  35.75 
 
 
369 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  31.44 
 
 
215 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  35.14 
 
 
490 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  34.78 
 
 
376 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  32.45 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  31.91 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  32.45 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  31.91 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  31.91 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  31.91 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  32.45 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  31.38 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  34.94 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  36.9 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  30.94 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  25.15 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  29.94 
 
 
369 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  26.13 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  25.9 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  26.45 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>