39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0498 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  43.43 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  38.27 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  40.49 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  37.31 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  37.2 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  33.01 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  33.97 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  33.66 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  34.78 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  33.03 
 
 		 490 aa  100  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  36.18 
 
 		 376 aa  91.3  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  35.85 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  35.15 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  35.22 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  35.22 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  35.22 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  37.13 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  35.22 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  36.53 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  34.81 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  35.82 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  34.97 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  27.57 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  26.94 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  25.44 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  27.61 
 
 		 287 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  29.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  23.08 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  28.1 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  27.78 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  23.36 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  24.9 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  25.48 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>