39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3482 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  54.19 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  38.86 
 
 
220 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  38.66 
 
 
206 aa  141  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  35.57 
 
 
210 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  36.84 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  32.72 
 
 
225 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  31.44 
 
 
222 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  36.32 
 
 
376 aa  105  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 
235 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  30.09 
 
 
490 aa  93.2  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  33.99 
 
 
369 aa  92.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  31.69 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  30.5 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  28.89 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  29.44 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  29.35 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  31.25 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  30.56 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  28.33 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  28.33 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  28.33 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  29.87 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  28.96 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  29.55 
 
 
210 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  29.93 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  23.74 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 
183 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  27.88 
 
 
430 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  24.85 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
276 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  28.47 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  26.95 
 
 
431 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  26.57 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  26.24 
 
 
431 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  26.35 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  26.24 
 
 
431 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.65 
 
 
303 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  26.24 
 
 
431 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>