33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2546 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  63.68 
 
 
206 aa  266  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  60.4 
 
 
204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  45.33 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  39.13 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  39.81 
 
 
235 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  40.49 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  40.1 
 
 
369 aa  132  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  35.57 
 
 
215 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  34.56 
 
 
490 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 
209 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  35.64 
 
 
376 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  31.5 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  30.5 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  30.24 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  30.5 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  30.5 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  30.24 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  30.5 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  30 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  31.75 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  31.65 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  30.61 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  30.61 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  26.81 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33435  predicted protein  28.28 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  25.36 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  26.03 
 
 
250 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  28.87 
 
 
260 aa  45.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  23.02 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  23.68 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>