108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2449 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  287  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  61.03 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  57.35 
 
 		 135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  53.33 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  75.95 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  41.51 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  49.41 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  37.1 
 
 		 187 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.5 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  34.15 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  36.7 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  36.7 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  39.05 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.83 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  50.82 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  36.79 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  34.58 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  52.54 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  43.55 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  45.31 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  37.14 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  47.17 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  36.54 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  36.54 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  29.09 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.74 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  35.38 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.84 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  38 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  29.31 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  30.17 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  30.86 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  35.85 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  32.26 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  34.57 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  46.81 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  35.94 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  30.77 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  44.68 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  39.68 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  48.57 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  47.5 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  34.48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  42.31 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  28.07 
 
 		 136 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  38 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  25.83 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  41.86 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  35.53 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  37.1 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.29 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  47.5 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  38.18 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  27.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.64 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  51.28 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  30.65 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  37.25 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  30.36 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  28.81 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>