127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0171 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  91.18 
 
 		 136 aa  258  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  55.88 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  49.25 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  49.64 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  47.69 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  45.8 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  47.01 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  45.8 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  43.38 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  44.78 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 136 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40.44 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  41.22 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  39.13 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  50.59 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  40.31 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  40.29 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  38.06 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  40.31 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.52 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  36.64 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  39.82 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  34.33 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  43.18 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  37.01 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  34.35 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36.97 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  30.67 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  47.62 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.3 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  65.12 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  41.18 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  31.69 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  46.05 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  49.02 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  32.67 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  32.08 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  29.25 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  35.38 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  38.1 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  29.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  28.97 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  45.76 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  43.1 
 
 		 80 aa  48.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  46.94 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  52.5 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  41.51 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  41.51 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  29.85 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  49.02 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  38.78 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  39.22 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  28.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  36.21 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  40.3 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  45.65 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  33.7 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  55.88 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  28.41 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  35.59 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  45 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>