68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0719 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  52.94 
 
 
67 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  52.27 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  52.27 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.98 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  47.17 
 
 
72 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  47.27 
 
 
68 aa  53.9  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  43.08 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  52.08 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  52.38 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  51.16 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  51.16 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  45.28 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  42.19 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  45.28 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  46.3 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  42.65 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  46.3 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  37.7 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  39.06 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  42.59 
 
 
72 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  42.59 
 
 
72 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 
72 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 
72 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.5 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  35.29 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  43.18 
 
 
57 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 
56 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 
56 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  40.91 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  48.65 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  40.32 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  55 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  35.82 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  35.42 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  36.23 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  39.22 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  47.5 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  39.53 
 
 
48 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
212 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  36.07 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  35.09 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  43.14 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  33.82 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  39.68 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  51.72 
 
 
55 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
135 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>